forked from jinghuazhao/Omics-analysis
-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 0
/
ldsc_CNS.results
55 lines (55 loc) · 11.3 KB
/
ldsc_CNS.results
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
Category Prop._SNPs Prop._h2 Prop._h2_std_error Enrichment Enrichment_std_error Enrichment_p Coefficient Coefficient_std_error Coefficient_z-score
L2_0 0.1484080528635455 0.3956384717122209 0.02206861591021365 2.6658827744070774 0.14870228053261197 1.0250973656252946e-26 4.0852585740764536e-08 5.037357971550159e-09 8.109923092917072
baseL2_1 1.0 0.9999999999999999 0.0 0.9999999999999999 0.0 NA -8.51124260791987e-09 8.6563824964741e-09 -0.9832331937026408
Coding_UCSC.bedL2_1 0.01427490862095777 0.0954312649896865 0.012156560323832362 6.685245245603791 0.851603372506683 7.86749435324318e-10 5.243190636282564e-08 3.7350027237855936e-08 1.4037983434101367
Coding_UCSC.extend.500.bedL2_1 0.0636617812073122 0.10438977915228631 0.016733941173461414 1.6397558656479454 0.2628569426759827 0.016443170248544633 -3.953776986075257e-08 1.1567267532123754e-08 -3.418073434452105
Conserved_LindbladToh.bedL2_1 0.025685105866157906 0.3542813328709319 0.033182584203541705 13.793259592428804 1.2918998417391108 1.0312948531616409e-19 3.439951181078354e-07 3.83900205917527e-08 8.96053486831772
Conserved_LindbladToh.extend.500.bedL2_1 0.33041242483215094 0.6336644206844191 0.05167563735573387 1.9177984030301516 0.15639737937211357 5.101501159507685e-09 5.6583723124986425e-09 8.094736776573826e-09 0.6990186918583907
CTCF_Hoffman.bedL2_1 0.02386616428114063 -0.009885587312036283 0.01851832673647286 -0.4142093046702109 0.7759238777680876 0.07148490010400747 -7.15115883531641e-08 2.9770538240382766e-08 -2.4020925579424346
CTCF_Hoffman.extend.500.bedL2_1 0.07083572171116388 0.0859596314305228 0.024325131375184418 1.2135068204856783 0.34340204048984396 0.5327497989128005 1.4497169665275612e-08 1.6065992051646266e-08 0.9023513530115372
DGF_ENCODE.bedL2_1 0.13600559891121844 0.19716923084233773 0.05922806321937695 1.4497140736907868 0.4354825367008587 0.2957602332890879 -3.2936187141411655e-09 1.7048187668718776e-08 -0.19319465377452003
DGF_ENCODE.extend.500.bedL2_1 0.5384702874055196 0.6558793561795329 0.038715279585768925 1.2180418706846734 0.07189863673315854 0.0029638983186364163 -9.170729759278927e-09 7.776191254942727e-09 -1.1793343885992773
DHS_peaks_Trynka.bedL2_1 0.11058285813211827 0.1965932032782981 0.053111847356793696 1.7777909397442002 0.48029005809687614 0.09978736977726581 1.903053650350657e-08 2.1382757120896876e-08 0.8899945126771545
DHS_Trynka.bedL2_1 0.1662005660308675 0.21791404254220115 0.0529896274539927 1.3111510252120875 0.3188294042521566 0.3245006623991624 -5.25121323977929e-08 1.8372863888676883e-08 -2.858135384661283
DHS_Trynka.extend.500.bedL2_1 0.49604212872027065 0.7662384004604166 0.06395435851839822 1.5447042823504125 0.1289292880896887 7.357971451767126e-05 2.1218519732639085e-08 1.3214503880727746e-08 1.6056993076815036
Enhancer_Andersson.bedL2_1 0.00432768191554696 0.008479467532805018 0.0072077857102546715 1.9593555391266155 1.6655072740815577 0.5645641357390607 2.516094303858514e-08 5.645524435426852e-08 0.4456794639076387
Enhancer_Andersson.extend.500.bedL2_1 0.019035056773355652 0.01567563457548523 0.01080360248651767 0.823513938630707 0.567563449647286 0.7562294423789953 -4.319930076321754e-08 2.232921078622101e-08 -1.9346541701274602
Enhancer_Hoffman.bedL2_1 0.041989150096482915 0.14746701751290625 0.020693231794257215 3.5120267300970767 0.4928233066567955 1.4347357021197227e-06 6.305275250600731e-08 2.7743764099945637e-08 2.27268197202307
Enhancer_Hoffman.extend.500.bedL2_1 0.08984511233469868 0.17129254079932954 0.018725443386589203 1.9065315446567195 0.2084191660513661 1.810881662500495e-05 -2.863971100804772e-08 1.7554113645836208e-08 -1.6315099460940876
FetalDHS_Trynka.bedL2_1 0.08393082620342789 0.16266236478346405 0.04080740752880767 1.9380527053220002 0.48620285745669234 0.05123279776906696 -1.2853359714028776e-08 2.0320058207755607e-08 -0.6325454180600232
FetalDHS_Trynka.extend.500.bedL2_1 0.2833618428899481 0.5411117676084032 0.04233175361064694 1.9096140894967282 0.14939115718233004 1.4989523705555477e-08 1.4064362777831154e-08 8.417449105416682e-09 1.6708580713343009
H3K27ac_Hnisz.bedL2_1 0.3890758491763095 0.467359057927267 0.024122065333797526 1.2012029503159511 0.06199836197714401 0.0011912618593514402 -2.4045857157932023e-08 1.9989049288294404e-08 -1.2029515166593385
H3K27ac_Hnisz.extend.500.bedL2_1 0.4204863517312657 0.5221215034362627 0.029393161540317406 1.24170856268351 0.06990277191946215 0.0006904600416930606 1.724323051201614e-08 2.1322402265502937e-08 0.808690798405656
H3K27ac_PGC2.bedL2_1 0.2687779339554607 0.3849937587839782 0.03280317272706414 1.43238603377231 0.1220456316644653 0.0003969430419366553 -1.2683530342766388e-08 1.5223092246540854e-08 -0.8331770009242682
H3K27ac_PGC2.extend.500.bedL2_1 0.33520645901241686 0.4463912668258899 0.031168996394030545 1.3316905292966164 0.09298447436204077 0.00057960198655421 -2.1485700357670127e-09 1.4304969824855446e-08 -0.150197453197964
H3K4me1_peaks_Trynka.bedL2_1 0.16982251270264725 0.37418204448951725 0.04467115264232281 2.2033712641191205 0.2630461175694668 4.733610267938774e-06 2.0825199249646123e-08 1.2527406549751593e-08 1.6623711513584645
H3K4me1_Trynka.bedL2_1 0.4236845553020814 0.5518800407396404 0.051457269039106864 1.3025729492219922 0.12145184051473985 0.011497141631243588 -3.5975416393833875e-08 1.526491652183782e-08 -2.3567384952526824
H3K4me1_Trynka.extend.500.bedL2_1 0.6058191032985364 0.8496279506637976 0.03426879557531907 1.4024449642439167 0.05656605311508647 3.019370492856634e-10 2.9531087463352763e-08 1.2881122346587653e-08 2.292586520706083
H3K4me3_peaks_Trynka.bedL2_1 0.04164878004428334 0.12827977750140154 0.028326488966091894 3.0800368549812798 0.6801276996822853 0.002863703334736194 5.662758612334607e-09 2.7184110800040247e-08 0.20831134238631133
H3K4me3_Trynka.bedL2_1 0.133010543754998 0.2880078953950145 0.027484431398675666 2.1653012405205834 0.20663347899172027 5.427696058532111e-08 8.655633515219187e-09 1.517961076761729e-08 0.5702144572563268
H3K4me3_Trynka.extend.500.bedL2_1 0.25513914324378867 0.36487016963729724 0.03519956796506187 1.4300830715287745 0.1379622409856109 0.001486239217572616 -1.3273175688084955e-08 1.0998307234104273e-08 -1.2068380529438767
H3K9ac_peaks_Trynka.bedL2_1 0.038459467361967696 0.17224823371344694 0.026909515417261682 4.4786952479685675 0.6996850779028811 3.0168009470806856e-06 5.827251616959135e-08 2.8764240979801308e-08 2.0258666380423946
H3K9ac_Trynka.bedL2_1 0.12541286015018221 0.3231896613294331 0.030270874844185072 2.5770057467983163 0.24136978303449602 1.4392666640487789e-10 1.0655441546520545e-08 1.7034977017269836e-08 0.6255037230586339
H3K9ac_Trynka.extend.500.bedL2_1 0.2298547983705853 0.4079177217275428 0.027191182125385446 1.7746756849072782 0.11829721336313474 4.0396548694150074e-10 1.4896274688830868e-11 1.0466900449938368e-08 0.0014231791694281932
Intron_UCSC.bedL2_1 0.3874729729571045 0.43287035820625713 0.01809910079705894 1.1171627143506042 0.04671061483057972 0.010203119726532458 4.06653583006336e-09 4.720452521906478e-08 0.08614716091712715
Intron_UCSC.extend.500.bedL2_1 0.39679649544660694 0.49512426653375113 0.018379163488755065 1.247804031072586 0.046318865462933935 6.517095487541424e-08 -3.254430834236414e-10 4.6987361612822344e-08 -0.0069261833874671415
PromoterFlanking_Hoffman.bedL2_1 0.008308451426979217 0.014532375211374779 0.012594402730842006 1.7491075610293907 1.5158544093963697 0.6196147113001644 -1.3238959591038543e-08 5.293587470184827e-08 -0.2500942822916328
PromoterFlanking_Hoffman.extend.500.bedL2_1 0.033186499470992135 0.06012832889955369 0.014751753977382197 1.8118310113457745 0.44451069599179943 0.06432268463259079 -6.036936134651213e-09 2.088316597371438e-08 -0.2890814612233556
Promoter_UCSC.bedL2_1 0.04634551770888849 0.09337116013162552 0.020819513196523746 2.0146750915184644 0.4492238780737759 0.024499114238556854 2.2509063371329824e-08 4.8813822018769e-08 0.46112069164907943
Promoter_UCSC.extend.500.bedL2_1 0.05693456591243414 0.0986780893505435 0.01653284087005791 1.733184187305674 0.2903831899848954 0.012526078427406355 -2.2601821262650185e-08 3.838796175823749e-08 -0.5887736735019584
Repressed_Hoffman.bedL2_1 0.4608732966189964 0.424681037759992 0.05890877506310717 0.9214702628151518 0.1278198921379622 0.5356161900473566 1.1786645713704314e-08 9.761494635643091e-09 1.2074632168179034
Repressed_Hoffman.extend.500.bedL2_1 0.7185106117786826 0.601447712916658 0.018821218280062724 0.8370756159436061 0.026194767302699325 7.858892128189144e-10 6.251867968957224e-10 7.333170825282628e-09 0.08525463429002106
SuperEnhancer_Hnisz.bedL2_1 0.16720976575192845 0.23082900521817942 0.01263139358524883 1.3804756210270408 0.07554220011281339 3.495965194793006e-07 -2.687019213724781e-08 5.463223355212116e-08 -0.4918377007524808
SuperEnhancer_Hnisz.extend.500.bedL2_1 0.17038297418337608 0.23766890711038638 0.012887650399705514 1.3949099565229637 0.07563930880696491 1.2639827479711844e-07 2.6578807024019476e-08 5.3671627334483096e-08 0.495211498961632
TFBS_ENCODE.bedL2_1 0.1312281722396601 0.28205503426360745 0.03688850663812616 2.1493481883485694 0.28110203783648846 5.2214797694480937e-05 2.247197384692607e-08 1.4450381045877411e-08 1.5551128911813132
TFBS_ENCODE.extend.500.bedL2_1 0.34121451885447107 0.5298548042180508 0.04018436360622944 1.5528495270274103 0.1177686217489713 6.299060892031516e-06 3.704074040399071e-09 8.683694133615265e-09 0.42655510240282507
Transcribed_Hoffman.bedL2_1 0.3459677891497274 0.3588783734810132 0.044573704052210575 1.0373173015991335 0.1288377283959231 0.7715100313275391 5.194492219967061e-09 6.803123156161545e-09 0.7635452277918037
Transcribed_Hoffman.extend.500.bedL2_1 0.7620952569793894 0.7589950672017614 0.032028713940160346 0.9959320180131866 0.04202717920999546 0.9224730026165686 4.327590892844299e-09 6.63277307779157e-09 0.6524557439382808
TSS_Hoffman.bedL2_1 0.017832102784039145 0.06317041952090029 0.01353466958301068 3.5425109582388563 0.7590058080601163 0.0008324916738702662 -1.3943116436024912e-08 3.850635145189538e-08 -0.3620991319690091
TSS_Hoffman.extend.500.bedL2_1 0.03435338664846886 0.11232033218776925 0.01678214650681648 3.26955631295162 0.4885150532186166 5.817578902256452e-06 3.3825333442938235e-08 2.9028883351709494e-08 1.165230265081701
UTR_3_UCSC.bedL2_1 0.011185912001340679 0.0467513494257666 0.010047284459820062 4.179484821636649 0.8982087878588579 0.0003986966819429475 4.754640184162844e-08 4.4900812735313437e-08 1.0589207398518716
UTR_3_UCSC.extend.500.bedL2_1 0.026455258113397075 0.05466424125956902 0.011684960469127493 2.066290225756171 0.44168763801288224 0.016450190429134124 -1.652038539820191e-08 2.032436793430266e-08 -0.8128363672416823
UTR_5_UCSC.bedL2_1 0.005484168431004776 0.028894700407647547 0.007402994630943919 5.268747809474851 1.3498846222685372 0.0018019305844232925 4.7224195260890984e-08 4.1157586783810267e-08 1.1473995185613526
UTR_5_UCSC.extend.500.bedL2_1 0.02686507774746488 0.04818205857078468 0.01241018450409327 1.793482938099123 0.4619448572139106 0.08778664814988571 -1.731665343686106e-08 1.7132011936231738e-08 -1.0107775724950805
WeakEnhancer_Hoffman.bedL2_1 0.020987193933260293 0.06405635485609819 0.01701287660977791 3.052163860485528 0.8106313146902442 0.010823629043601164 1.8670570656820427e-08 2.7715757408169206e-08 0.6736446124080046
WeakEnhancer_Hoffman.extend.500.bedL2_1 0.08878659334535449 0.19727566174411157 0.022483062025573798 2.2219082218501796 0.2532258664111721 4.256299078107041e-06 1.9578241478924163e-08 1.1921993741055828e-08 1.6421952488955331